Nella Discinesia Ciliare Primitiva il deficit della clearance muco ciliare fa si che i batteri inalati restino più a lungo a contatto con la mucosa bronchiale (circa 1 settimana) riuscendo così più facilmente a moltiplicarsi e a creare un danno. Quando l’infezione persiste le tossine prodotte da alcuni patogeni danneggiano le cellule dell’epitelio bronchiale provocando una discinesia ciliare secondaria. I batteri che svolgono un ruolo determinante  nelle discinesie ciliari sono: Streptococcus Pneumoniae, Haemophilus influenzae non tipizzabile, Pseudomonas Aeruginosa e Staphylococcus aureus.
Fondamentale è quindi la prevenzione con i vaccini anti-pneumococchi meno quella per  H influenzae in quanto specificamente attivo sul tipo b.
Determinante è la terapia antibiotica mirata al fine di evitare la selezione di ceppi batterici resistenti.
In discussione si è parlato del ruolo dei macrolidi anche perché nella relazione si era accennato ad un possibile coinvolgimento del Mycoplasma pneumoniae nelle malattie respiratorie croniche del bambino. Secondo la  relatrice un macrolide è indicato come antibiotico di prima scelta nella polmonite del bambino  anche sotto i 4 anni. Questo approccio non è giustificato  perché da un lato l’infezione da Mycoplasma è rara anche nel bambino in età scolare, dall’altro l’agente infettivo in assoluto più frequente nelle polmoniti (lo pneumococco) è nel 40% dei casi  resistente ai macrolidi, percentuale che sale al 60% nel bambino in età prescolare. L’uso del macrolide nella polmonite non solo ha pochissime probabilità  di colpire un Mycoplasma ma è completamente inutile nel 40-60 % dei pazienti e in più rischia di creare nuove resistenze.

Il Dott. Baldini ha illustrato il rapporto tra inquinamento dell’aria e malattie respiratorie, ponendo l'accento sull'inquinamento outdoor, che deriva per lo più dalle attività umane di tipo mobile (ad es. traffico autoveicolare leggero e pesante, traffico aereo) o fisso (ad es. impianti industriali, centrali elettriche) e che comprende l'emissione di monossido di carbonio (CO), di ossidi di azoto (NOx), di composti organici volatili (VOCs), nonchè metalli pesanti come cadmio, zinco e mercurio, prodotto anche dall’incenerimento dei rifiuti domestici. Il particolato (PM) è invece una miscela di particelle solide e di gocce liquide sospese nell’aria, che variano nella dimensione, composizione e concentrazione. Il PM è generalmente classificato in base alla dimensione. Si parla di PM10 per indicare particelle dal diametro medio aerodinamico < 10 micron e di PM2,5 per le particelle “fini” dal diametro medio aerodinamico < 2,5 micron. Lo stress ossidativo sembra essere il comune denominatore degli effetti nocivi degli inquinanti ambientali e alcuni studi preliminari sembrano indicare che la supplementazione con antiossidanti possa essere di qualche beneficio.